ระเบิดฐานข้อมูลหรือไม่?

2024 ผู้เขียน: Fiona Howard | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2024-01-10 06:43

BLAST คือ อัลกอริทึมคอมพิวเตอร์ ที่พร้อมให้ใช้งานออนไลน์ได้ที่เว็บไซต์ National Center for Biotechnology Information (NCBI) รวมถึงเว็บไซต์อื่นๆ อีกมากมาย BLAST สามารถจัดตำแหน่งและเปรียบเทียบลำดับ DNA ของแบบสอบถามกับฐานข้อมูลของลำดับได้อย่างรวดเร็ว ซึ่งทำให้เป็นเครื่องมือที่สำคัญในการวิจัยจีโนมอย่างต่อเนื่อง

BLAST เป็นฐานข้อมูลหลักหรือไม่

BLAST เป็นซอฟต์แวร์ที่ใช้กันอย่างแพร่หลายมากที่สุดในการวิจัยชีวสารสนเทศ หน้าที่หลักของมันคือการเปรียบเทียบลำดับความสนใจ ลำดับการสืบค้น กับลำดับในฐานข้อมูลขนาดใหญ่ ขนาดใหญ่ BLAST จะรายงานผลการจับคู่ที่ดีที่สุด หรือ “hits” ที่พบในฐานข้อมูล โปรแกรมง่าย ๆ นี้มีสองแอปพลิเคชันหลัก

NCBI เป็นฐานข้อมูลหรือไม่

NCBI เป็นที่ตั้งของ ชุดฐานข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับเทคโนโลยีชีวภาพและชีวการแพทย์ และเป็นทรัพยากรที่สำคัญสำหรับเครื่องมือและบริการด้านชีวสารสนเทศฐานข้อมูลหลัก ได้แก่ GenBank สำหรับลำดับ DNA และ PubMed ซึ่งเป็นฐานข้อมูลบรรณานุกรมสำหรับวรรณกรรมชีวการแพทย์ ฐานข้อมูลอื่นๆ ได้แก่ ฐานข้อมูล NCBI Epigenomics

BLAST ใช้ในฐานข้อมูล NCBI เท่านั้นหรือไม่

BLAST มีอยู่บนเว็บที่เว็บไซต์ NCBI BLAST ประเภทต่างๆ จะพร้อมใช้งานตามลำดับการสืบค้นและฐานข้อมูลเป้าหมาย

ฐานข้อมูล BLAST ทำงานอย่างไร

BLAST ทำงานอย่างไร? BLAST ระบุลำดับที่คล้ายคลึงกันโดยใช้วิธีฮิวริสติก ซึ่งในขั้นต้นจะค้นหาการจับคู่แบบสั้นระหว่างสองลำดับ ดังนั้นเมธอดนี้จึงไม่คำนึงถึงพื้นที่ของลำดับทั้งหมด หลังจากการจับคู่ครั้งแรก BLAST จะพยายามเริ่มต้นการจัดตำแหน่งในพื้นที่จากการจับคู่เริ่มต้นเหล่านี้