ทำไมเอ็นไซม์จำกัดพาลินโดรมิก?

2024 ผู้เขียน: Fiona Howard | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2024-01-10 06:43

คำอธิบาย: เอ็นไซม์อย่างเช่น เอ็นไซม์จำกัดมี เพื่อจดจำลำดับที่เฉพาะเจาะจงมากเพื่อทำงานของมัน มันผูกมัดกับ DNA ในรูปแบบเฉพาะเดียวเท่านั้น … ลำดับพาลินโดรมยังเพิ่มโอกาสที่ DNA ทั้งสองเส้นจะถูกตัดอีกด้วย

พาลินโดรมเกี่ยวข้องกับเอ็นไซม์จำกัดอย่างไร

เอ็นไซม์จำกัดตัด DNA สายคู่ ที่ตำแหน่งเฉพาะตามรูปแบบของฐานที่พบในตำแหน่งเหล่านั้น เอ็นไซม์เหล่านี้ คาดคะเนได้ตัดทั้งสองเส้นเพราะลำดับที่พวกมันรับรู้ เป็นพาลินโดรม นั่นคือลำดับการจดจำเป็นสตริงสั้น ๆ ของเบสที่เหมือนกันบนสาย DNA ทั้งสองเส้น

เอ็นไซม์จำกัดทั้งหมดตัดพาลินโดรมหรือไม่

เอ็นไซม์ที่มีข้อจำกัดมากที่สุดตัดแยกลำดับการรู้จำพาลินโดรมไม่สมมาตร โดยเหลือส่วนที่ยื่นเป็นเกลียวเดี่ยวที่แต่ละด้านของการตัด (ดูรูปที่ 4, บนสุด) ที่บริเวณรอยแยกสำหรับการรู้จำเอ็นไซม์ใดๆ ส่วนยื่นเหล่านี้มีลำดับที่ซ้ำกันและเสริมกัน

ไซต์จำกัดทั้งหมดเป็น palindromes หรือไม่

ระบบการจำกัด-ปรับเปลี่ยนถูกใช้เป็นกลไกป้องกันจากการบุกรุก DNA ต่างประเทศที่ไม่เหมาะสม ลำดับการจดจำสำหรับเอ็นไซม์จำกัดประเภท II ทั่วไปและเมทิลเลสที่สอดคล้องกันคือ โดยปกติคือพาลินโดรม.

เมื่อเอนไซม์เป็นพาลินโดรมหมายความว่าอย่างไร

ลำดับ palindromic จะเหมือนกันทั้งข้างหน้าและข้างหลัง (ดูภาพด้านล่าง) ซึ่งหมายความว่า เอ็นไซม์รับรู้ลำดับไม่ว่าเอ็นไซม์จะเข้าใกล้ดีเอ็นเอจากด้านใด ลำดับพาลินโดรมก็เพิ่มโอกาสที่ดีเอ็นเอทั้งสองเส้นจะถูกตัดด้วยเช่นกัน