สารบัญ:
- เมตาเจโนมิกส์มีกระบวนการอย่างไร
- เทคนิคอะไรที่ใช้ใน metagenomics
- 3 ขั้นตอนในการศึกษาเมตาเจโนมิกส์คืออะไร
- เมตาเจโนมิกส์เชิงฟังก์ชันทำงานอย่างไร
2024 ผู้เขียน: Fiona Howard | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2024-01-10 06:43
Metagenomics ถูกกำหนดให้เป็น การวิเคราะห์ทางพันธุกรรมโดยตรงของจีโนมที่มีอยู่ในตัวอย่างสิ่งแวดล้อม ฟิลด์เริ่มแรกด้วยการโคลนของ DNA สิ่งแวดล้อม ตามด้วยการตรวจคัดกรองการแสดงออกเชิงหน้าที่ [1], และเสริมด้วยปืนลูกซองสุ่มลำดับโดยตรงของ DNA สิ่งแวดล้อม [2, 3]
เมตาเจโนมิกส์มีกระบวนการอย่างไร
Metagenomics เกี่ยวข้องกับการได้รับ DNA จากจุลินทรีย์ทั้งหมดภายในชุมชน โดยไม่จำเป็นต้องระบุสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องทั้งหมด หลังจากที่จัดลำดับยีนและเปรียบเทียบกับลำดับที่ระบุแล้ว ก็สามารถกำหนดหน้าที่ของยีนเหล่านี้ได้
เทคนิคอะไรที่ใช้ใน metagenomics
เก็บตัวอย่างจุลินทรีย์จากน้ำทะเล ตะกอน สัตว์ที่เป็นที่อยู่อาศัย หรือแหล่งที่อยู่อาศัยทางทะเลอื่นๆจากนั้นเซลล์ที่เก็บรวบรวมจะถูก lysed และ DNA ถูกสกัดจาก lysate เทคนิคที่ทำให้ metagenomics เป็นไปได้คือ shotgun sequencing ซึ่งจัดลำดับส่วนสุ่มของ DNA ในลักษณะที่ไม่เป็นเป้าหมาย
3 ขั้นตอนในการศึกษาเมตาเจโนมิกส์คืออะไร
ขั้นตอนและกระบวนการเมตาเจโนมิกส์:
- เก็บตัวอย่าง:
- การสกัดดีเอ็นเอ:
- การเตรียมตัวอย่าง:
- การวิเคราะห์ตัวอย่าง:
เมตาเจโนมิกส์เชิงฟังก์ชันทำงานอย่างไร
เมทาเจโนมิกส์เชิงฟังก์ชันเกี่ยวข้องกับ การแยก DNA ออกจากชุมชนจุลินทรีย์เพื่อศึกษาการทำงานของโปรตีนที่เข้ารหัส มันเกี่ยวข้องกับการโคลนชิ้นส่วนดีเอ็นเอ การแสดงยีนในโฮสต์ตัวแทน และการคัดกรองกิจกรรมของเอนไซม์
