จะเลือกอะตอมใน pymol ได้อย่างไร?

สารบัญ:

จะเลือกอะตอมใน pymol ได้อย่างไร?
จะเลือกอะตอมใน pymol ได้อย่างไร?
Anonim

เมื่อคุณ คลิกซ้ายและปล่อย บนอะตอมโดยใช้ปุ่มซ้าย โดยค่าเริ่มต้น PyMOL ควรเลือกสารตกค้างทั้งหมด: สิ่งนี้จะสร้างรายการ “(sele)” ในแผงควบคุมซึ่งสามารถดำเนินการได้โดยใช้เมนูป๊อปอัป

คุณเลือกสิ่งของใน PyMOL อย่างไร

select

  1. การใช้งาน. เลือกชื่อ, การเลือก [, เปิดใช้งาน [, เงียบ [, รวม [, สถานะ [, โดเมน]
  2. ข้อโต้แย้ง. ชื่อ=ชื่อเฉพาะสำหรับการเลือก …
  3. ตัวอย่าง select chaA, chain A select (resn his) select near142, resi 142 รอบ 5.
  4. หมายเหตุ. …
  5. ดูเพิ่มเติม …
  6. บวก

คุณจะเลือกพันธบัตรใน PyMOL อย่างไร

คุณสามารถสร้างพันธะใหม่ได้ง่ายๆ โดยเลือกอะตอมสองตัว แต่ละอะตอมมี CTRL-MIDDLE-MOUSE-BUTTON แล้วพิมพ์ "bond" บนบรรทัดคำสั่ง.

คุณจะเลือกกรดอะมิโนจำเพาะใน PyMOL ได้อย่างไร

– ภายใต้เมนู “แสดงผล” เลือก “เปิดลำดับ” แถบจะปรากฏเหนือโครงสร้างที่แสดงลำดับกรดอะมิโนของสายโปรตีนทั้งหมดในหน้าต่าง ใช้ option-shift เพื่อเลือก aa ทั้งหมดสำหรับเชนเดียว

คุณจะเลือกลำดับใน PyMOL ได้อย่างไร

คำตอบล่าสุด

  1. โหลดโครงสร้างโปรตีนของคุณใน pymol
  2. คลิกที่ปุ่ม 'S' เพื่อโหลดลำดับกรดอะมิโน
  3. ค้นหาลำดับกรดอะมิโนที่คุณต้องการดูและเลือก
  4. คุณสามารถเปลี่ยนสีหรือโหมดของรูปลักษณ์ได้ (เช่น การ์ตูน ทรงกลม ริบบิ้น ไม้เท้า ฯลฯ)

แนะนำ: