เอนโทรปีของโครงสร้างเกี่ยวข้องกับการพับของโปรตีนหรือไม่?

2024 ผู้เขียน: Fiona Howard | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2024-01-10 06:43

การสูญเสียเอนโทรปีของโครงสร้างคือ ส่วนสำคัญในอุณหพลศาสตร์ของการพับโปรตีน อย่างไรก็ตาม การกำหนดปริมาณที่แม่นยำได้พิสูจน์แล้วว่ามีความท้าทาย เราคำนวณการสูญเสียนี้โดยใช้การจำลองแบบไดนามิกของโมเลกุลของทั้งโปรตีนพื้นเมืองและชุดสถานะที่แปลงสภาพเหมือนจริง

โปรตีนเอนโทรปีตามโครงสร้างคืออะไร

เอนโทรปีโครงสร้างคือ เอนโทรปีที่เกี่ยวข้องกับจำนวนโครงสร้างของโมเลกุล … ในโปรตีน โดยทั่วไปจะใช้มุมไดฮีดรัลของกระดูกสันหลังและโรตาเมอร์สายด้านข้างเป็นพารามิเตอร์ และใน RNA อาจใช้รูปแบบการจับคู่ฐาน

เอนโทรปีรูปแบบใดที่มีโปรตีนพับหรือกางออก

โครงสร้างเอนโทรปีของสายโซ่โพลีเปปไทด์มีขนาดใหญ่กว่าสำหรับ สถานะกางออก เมื่อเทียบกับสถานะพับที่กะทัดรัดกว่าซึ่งมีลักษณะเฉพาะด้วยพื้นที่โครงสร้างที่จำกัดมากกว่ามาก ดังนั้น การสนับสนุนนี้ทำให้สถานะที่แฉมีเสถียรภาพ (ΔS_{conf > 0)}

อะไรเป็นตัวกำหนดโครงสร้างของโปรตีนและปัญหาที่เกี่ยวข้องกับการพับของโปรตีนคืออะไร

โครงสร้างหลักของโปรตีน ลำดับกรดอะมิโนเชิงเส้น กำหนดรูปแบบดั้งเดิมของมัน สารตกค้างของกรดอะมิโนจำเพาะและตำแหน่งของพวกมันในสายโซ่โพลีเปปไทด์เป็นปัจจัยกำหนดว่าส่วนใดของโปรตีนจะพับชิดกันและสร้างโครงสร้างสามมิติ

ปัจจัยอะไรที่ส่งผลต่อการพับของโปรตีน

การพับโปรตีนเป็นกระบวนการที่ละเอียดอ่อนมาก ซึ่งได้รับอิทธิพลจากปัจจัยภายนอกหลายประการ รวมถึง สนามไฟฟ้าและสนามแม่เหล็ก อุณหภูมิ ค่า pH สารเคมี การจำกัดพื้นที่ และการรวมตัวของโมเลกุลปัจจัยเหล่านี้มีอิทธิพลต่อความสามารถของโปรตีนในการพับเป็นรูปแบบการทำงานที่ถูกต้อง