1.1 α-เฮลิซ. α-helix เป็นองค์ประกอบทั่วไปของโครงสร้างรองของโปรตีน ก่อตัว เมื่อกรดอะมิโน "ไขลาน" เพื่อสร้างเกลียวขวามือ โดยที่สายโซ่ด้านข้างชี้ออกมาจากขดลวดตรงกลาง (รูป 3.1A, B).
อะไรทำให้อัลฟ่าเฮลิซก่อตัว
เกลียวอัลฟ่ามีลักษณะเป็นเกลียวมือขวาอย่างแน่นหนาในสายกรดอะมิโนที่ทำให้มันมีรูปร่างเป็นแท่ง พันธะไฮโดรเจนระหว่างไฮโดรเจนในกลุ่มอะมิโนกับออกซิเจนในกลุ่มคาร์บอกซิลบนกรดอะมิโน ทำให้เกิดโครงสร้างนี้
alpha helices และ beta sheet เกิดขึ้นได้อย่างไร
เกลียวอัลฟ่าคือ ก่อตัวขึ้นเมื่อสายโซ่โพลีเปปไทด์บิดเป็นเกลียว สิ่งนี้ทำให้กรดอะมิโนทั้งหมดในสายโซ่สร้างพันธะไฮโดรเจนซึ่งกันและกัน… แผ่นจีบแบบเบตาเป็นสายโซ่โพลีเปปไทด์ที่เรียงต่อกัน เรียกว่าแผ่นจีบเพราะลักษณะเหมือนคลื่น
กรดอะมิโนอะไรสร้างเป็นเกลียว?
ลำดับกรดอะมิโนที่ต่างกันมีแนวโน้มที่แตกต่างกันสำหรับการสร้างโครงสร้าง α-helical เมไธโอนีน อะลานีน ลิวซีน กลูตาเมต และไลซีนไม่มีประจุ ("มาเล" ในรหัสกรดอะมิโน 1 ตัว) ล้วนมีแนวโน้มที่จะสร้างเกลียวสูงเป็นพิเศษ ในขณะที่โพรลีนและไกลซีนมีค่าต่ำ นิสัยชอบสร้างเกลียว
โครงสร้างโปรตีนทุติยภูมิเกิดจากโครงสร้างหลักอย่างไร
โครงสร้างหลักของโปรตีนถูกกำหนดโดยลำดับกรดอะมิโนเท่านั้น และถูกสร้างขึ้นโดยพันธะเปปไทด์ระหว่างส่วนที่เหลือของกรดอะมิโนที่อยู่ติดกัน โครงสร้างรองเป็นผลจาก พันธะไฮโดรเจนตามแกนหลักของโพลีเปปไทด์ ส่งผลให้เกิดเกลียวอัลฟาและแผ่นพับบีตา