สารบัญ:
- กรดอะมิโนชนิดใดที่ไม่พบในอัลฟาเฮลิซ
- ทำไมไกลซีนถึงเป็นตัวทำลายเกลียวอัลฟ่า
- ไกลซีนในอัลฟ่าเฮลิกซ์อยู่ที่ไหน
- ไกลซีนตกค้างอยู่ในอัลฟาเฮลิซหรือไม่
2024 ผู้เขียน: Fiona Howard | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2024-01-10 06:43
กรดอะมิโนทั้งหมดพบได้ใน α-เฮลิซ แต่ไกลซีนและโพรลีนนั้นพบได้ไม่บ่อย เนื่องจากพวกมันทำให้ α-helix ไม่เสถียร Glycine ได้รับการยกเว้นจากข้อจำกัดมากมาย เพราะขาด β carbon … ในทางกลับกัน โพรลีนแข็งเกินไป
กรดอะมิโนชนิดใดที่ไม่พบในอัลฟาเฮลิซ
Proline ไม่พบในโครงสร้างแบบเกลียวอัลฟาของโปรตีน เนื่องจากมีโครงสร้างแบบวงจรพิเศษ (เป็นกรดอะมิโน ไม่ใช่กรดอะมิโน)m โครงสร้างทุติยภูมิประเภทนี้มี ความกว้างจำเพาะและจำนวนเฉพาะของกรดอะมิโนตกค้าง/เทิร์น ดังนั้นโพรลีนจึงถูกพิจารณาว่าเป็นเฮลิคอลเบรกเกอร์อัลฟา
ทำไมไกลซีนถึงเป็นตัวทำลายเกลียวอัลฟ่า
โพรลีนและไกลซีนในบางครั้งเรียกว่า "ตัวทำลายเกลียว" เพราะมันขัดขวางความสม่ำเสมอของโครงสร้างกระดูกสันหลังแบบเกลียว α; อย่างไรก็ตาม ทั้งคู่มีความสามารถด้านโครงสร้างที่ผิดปกติและมักพบสลับกัน
ไกลซีนในอัลฟ่าเฮลิกซ์อยู่ที่ไหน
มีสามตำแหน่งในบรรทัดฐาน helix–turn–helix ที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้อย่างดี อะลานีนมักจะพบที่ตำแหน่ง 5 ภายในเกลียว α แรก; พบไกลซีนที่ ตำแหน่ง 9 ตำแหน่งแรกของเทิร์น; และมักจะพบวาลีนหรือไอโซลิวซีนที่ตำแหน่ง 15 ภายในเกลียว α ที่สอง
ไกลซีนตกค้างอยู่ในอัลฟาเฮลิซหรือไม่
Glycine ซึ่งมีรูปแบบสายโซ่หลักที่เป็นไปได้มากมาย คือ และไม่ค่อยพบในเกลียวเกลียว เมื่อทราบแนวโน้มที่กรดอะมิโนจะเกิดขึ้นในเกลียวอัลฟา (สิ่งที่เรียกว่าเอนเอียงที่เรียกว่าเกลียว) ก็เป็นไปได้ที่จะคาดการณ์ได้ว่าเกิดเฮลิซที่ใดในลำดับโปรตีน
