ไฟล์บิ๊กวิกคืออะไร?

2024 ผู้เขียน: Fiona Howard | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2024-01-10 06:43

BigWig คือ รูปแบบไฟล์สำหรับแสดงข้อมูลหนาแน่นต่อเนื่องในแทร็กเบราว์เซอร์จีโนม สร้างขึ้นโดยการแปลงจากรูปแบบ Wiggle (WIG) มีการอธิบายรูปแบบ BigWig ไว้ที่เว็บไซต์ UCSC Genome Bioinformatics และคู่มือรูปแบบไฟล์ Broad Institute จะให้ข้อมูลเพิ่มเติม

รูปแบบ bigWig คืออะไร

รูปแบบ bigWig คือ สำหรับการแสดงข้อมูลหนาแน่นต่อเนื่องซึ่งจะแสดงเป็นกราฟ ไฟล์ BigWig ถูกสร้างขึ้นในขั้นต้นจากไฟล์ประเภท WIG โดยใช้โปรแกรม wigToBigWig ของโปรแกรม UCSC อีกทางหนึ่ง ไฟล์ bigWig สามารถสร้างจากไฟล์ bedGraph โดยใช้โปรแกรม UCSC bedGraphToBigWig

ฉันจะใช้ไฟล์ bigWig ได้อย่างไร

ย้ายไฟล์ bigWig ที่สร้างขึ้นใหม่ (myBigWig.bw) ไปยัง http ที่เข้าถึงได้ทางเว็บ https หรือตำแหน่ง ftp วาง URL ลงในแบบฟอร์มรายการแทร็กที่กำหนดเองหรือสร้างแทร็กที่กำหนดเองโดยใช้แทร็กเดียว วางบรรทัดของแทร็กที่กำหนดเองลงในกล่องข้อความบนหน้าการจัดการแทร็กที่กำหนดเอง

เพลง bigWig คืออะไร

bigWig แทร็กคือ แทร็กสำหรับสัญญาณต่อเนื่องทั่วทั้งจีโนม เหมาะสำหรับแสดงผลการทดลอง "ดิบ" ต่างๆ เช่น สัญญาณ ChIP-Seq สัญญาณ RNA-Seq เป็นต้น

ฉันจะสร้างไฟล์ bigWig ได้อย่างไร

มีหลายวิธีในการสร้างไฟล์ bigwig ซึ่งมักจะเกี่ยวข้องกับการแปลงไฟล์. bam เป็นไฟล์ wiggle track (. wig) แล้วแปลงไฟล์ wiggle track เป็น binary bigwig (.